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我叫江户川柯南，是个初中生侦探。学历......已经到大学毕业了吧。至于这是什么原因，还得要从六年前说起。
在六年前的战役当中，全世界付出了巨大的代价，终于战胜了黑衣组织。琴酒在调查中得知了APTX-4869的药效之后由于种种原因对我的本体进行了绑架并且医学研究。在多种黑科技激素类药物的帮助下，本体恢复了原本工藤新一的大小，而我，其实是一个培养器皿中催熟长大的克隆体。
话虽这么说，但是不知道为何在克隆过程当中琴酒拷贝了工藤新一的所有记忆。在安室先生发现了秘密克隆基地之后将我和本体救出，并且通过学习装置给我植入了所有记忆。可惜的是，在之后琴酒毁坏了储存着APTX-4869数据的计算机，导致就算是药物研发人之一的灰原哀也无法再做出解药——至于琴酒，伏特加牺牲自己阻止了他的自杀。腿部落下残疾的琴酒在和我们的说服之下决定一改前非从善弃恶。我也想让警察去抓他，但是说实在的，完全没有任何证据......于是，我便莫名其妙有了一个哥哥，而且最神奇的事情是那个哥哥还是我自己......
还有一件事情需要感谢安室先生的，也不知道用了什么黑科技手段他居然成功给我和灰原办了身份证明！然后灰原就成为了阿笠博士的女儿，我成为了我们家的二胎孩子......其实感觉上有些诡异啊......
至于我和灰原，原本我是想回到高中继续读书的，可是由于身体的原因本身克隆体体质就比较差，再加上我这体型去高中实在是太显眼了，于是乖乖去到小学读一年级了。灰原那家伙不知道抽什么风，明明已经是科学家了，却也和我一起来读书。那天博士还神神秘秘地和我说什么我要努力给灰原补过一个阳光的童年。算了，在学校里这一天天的也算是清闲。不过自从小兰知道了我的身份之后我就一直住在自己家里了。当然偌大的房子里可不止有我一个人，还住着留守日本清扫黑衣组织残党的赤井先生和茱蒂老师——以及两岁的小妹妹。让人难以置信的是黑衣组织上层完全崩溃之后组织残党居然在这几年后还没有清除干净......家里倒是有人做饭有人做家务了。
就这样混吃等死顺便帮小五郎叔叔去解决一下案件的我不知不觉间已经到了初一。虽然说少年侦探团的各位一起报考了同一所国中学校，但是让我比较意外的是，少年侦探团的各位居然还是同班同学......反正上课也懒得听讲，开学选位置时我就干脆坐在了中间排的最后一位。紧接着，灰原就微笑着坐在了我的右手边位置。这熟悉的场面让我莫名想到了我俩第一次见面时的场景以及在街道上的那一句“我不叫灰原，我叫雪碧——咳咳，雪莉。”不过组织破碎之后灰原的心情似乎好了不少，现在的她倒像是会开这种玩笑呢。
接下来的故事，就在之后了。